Символика Федеральной службы исполнения наказаний учреждена Указом Президента РФ №1396 от 2 декабря 2005 года. Этим же указом утверждены положения о геральдическом знаке - эмблеме службы и ее флаге, а также официальные описания знака и флага.

Согласно Положению...:

"Флаг устанавливается в кабинетах директора ФСИН России, его заместителей, начальников структурных подразделений центрального аппарата ФСИН России, территориальных органов ФСИН России, образовательных и научно-исследовательских учреждений, подведомственных ФСИН России. Флаг поднят постоянно на зданиях ФСИН России, ее территориальных органов, образовательных и научно-исследовательских учреждений, подведомственных ФСИН России".

Описание флага Федеральной службы исполнения наказаний:

"Флаг Федеральной службы исполнения наказаний представляет собой темно-синее прямоугольное полотнище с Государственным флагом Российской Федерации в крыже.

В правой половине полотнища, ближе к его нижнему краю, располагается геральдический знак - эмблема Федеральной службы исполнения наказаний.

Отношение ширины флага к его длине - один к полутора. Отношение площади крыжа к площади флага - один к четырем. Отношение высоты эмблемы к ширине флага - один к двум".